O Colégio Nossa Senhora de Fátima ministra os cursos de educação infantil, Ensino Fundamental e Ensino Médio nos termos da legislação federal, estadual e municipal em vigor.
O Colégio manterá os seguintes níveis e modalidades de ensino:
Educação Infantil
Destinada a crianças de até 06 anos de idade, conforme a legislação vigente.
Ensino Fundamental
Com 08 séries anuais, cada uma com 200 dias e 800 horas de efetivo trabalho escolar, organizado em dois ciclos, sendo o 1ª ciclo de 1ª à 4ª Série e o segundo ciclo de 5ª à 8ª série, destinado a crianças e jovens a partir dos 07 anos ou a completar durante o ano letivo.
Ensino Médio
Com 3 séries anuais, cada uma, com um mínimo de 200 dias letivos e 800 horas de efetivo trabalho escolar, destinado aos jovens provenientes do Ensino Fundamental.